Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVPABLB-1P60509 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms