Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA9P57773 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJA9P57773 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA9P57773 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms