Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RIPPLY3P57055 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY3P57055 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms