Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2BFSP57053 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms