Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX3P56589 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX3P56589 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX3P56589 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX3P56589 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX3P56589 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX3P56589 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX3P56589 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms