Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP9P55211 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP9P55211 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP9P55211 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP9P55211 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP9P55211 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP9P55211 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms