Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKAP1LP55160 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms