Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGF8P55075 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGF8P55075 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGF8P55075 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms