Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMTNP53814 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMTNP53814 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMTNP53814 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMTNP53814 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMTNP53814 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMTNP53814 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms