Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A3P53794 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms