Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC3P51654 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC3P51654 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms