Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DAP3P51398 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms