Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPFP49454 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms