Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRPC1P48995 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRPC1P48995 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms