Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACTR1BP42025 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTR1BP42025 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms