Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PBX2P40425 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PBX2P40425 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PBX2P40425 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PBX2P40425 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PBX2P40425 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PBX2P40425 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PBX2P40425 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PBX2P40425 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PBX2P40425 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PBX2P40425 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PBX2P40425 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PBX2P40425 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PBX2P40425 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PBX2P40425 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms