Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX1P40424 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX1P40424 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX1P40424 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX1P40424 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX1P40424 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX1P40424 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX1P40424 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX1P40424 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms