Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPARGP37231 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPARGP37231 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms