Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL4P36578 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPL4P36578 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL4P36578 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms