Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms