Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF2P35240 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NF2P35240 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NF2P35240 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NF2P35240 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NF2P35240 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NF2P35240 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NF2P35240 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NF2P35240 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NF2P35240 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NF2P35240 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF2P35240 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms