Protein–RNA interactions for Protein: P34243

HCS1, DNA polymerase alpha-associated DNA helicase A, yeastyeast

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCS1P34243 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 MSL5YLR116W 1431 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 UBR1YGR184C 5853 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YCR064CYCR064C 411 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YDR269CYDR269C 324 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YPS5YGL259W 498 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YJR079WYJR079W 330 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 NFU1YKL040C 771 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 NCL1YBL024W 2055 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 MCD1YDL003W 1701 nt2.25□□□□□ -2.05
HCS1P34243 IPT1YDR072C 1584 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YHR130CYHR130C 336 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 UTP30YKR060W 825 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 LCL2YLR104W 396 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 PKR1YMR123W 369 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 UBP2YOR124C 3819 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 KAP123YER110C 3342 nt2.24□□□□□ -2.05
HCS1P34243 NOP14YDL148C 2433 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 NUP82YJL061W 2142 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YAP6YDR259C 1152 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 TIM9YEL020W-A 264 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YHR138CYHR138C 345 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 NCE101YJL205C 162 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YLR031WYLR031W 561 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YLR269CYLR269C 351 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 RPS17AYML024W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 CDC33YOL139C 642 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 DGK1YOR311C 873 nt2.23□□□□□ -2.05
HCS1P34243 RRP6YOR001W 2202 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YJL070CYJL070C 2667 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 BNI1YNL271C 5862 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YDL068WYDL068W 330 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 NOP10YHR072W-A 177 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 EMC6YLL014W 327 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 YLR101CYLR101C 396 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 VTI1YMR197C 654 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 ROX1YPR065W 1107 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 STH1YIL126W 4080 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 PDR11YIL013C 4236 nt2.22□□□□□ -2.05
HCS1P34243 ATG31YDR022C 591 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SMB1YER029C 591 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 GRX8YLR364W 330 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YPR097WYPR097W 3222 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 RAV1YJR033C 4074 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SSD1YDR293C 3753 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 TMN3YER113C 2121 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 NUP120YKL057C 3114 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 TAE2YPL009C 3117 nt2.21□□□□□ -2.06
HCS1P34243 VPS41YDR080W 2979 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 BFA1YJR053W 1725 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 CAJ1YER048C 1176 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YER135CYER135C 393 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SMD1YGR074W 441 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 ECL1YGR146C 636 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 RPC10YHR143W-A 213 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 RMP1YLR145W 606 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YML108WYML108W 318 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YOL159CYOL159C 516 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 snR43snR43 209 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 INO80YGL150C 4470 nt2.2□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SEC16YPL085W 6588 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 VOA1YGR106C 798 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 MSL1YIR009W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YKL111CYKL111C 336 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 IRC19YLL033W 693 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 MET18YIL128W 3099 nt2.19□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SWF1YDR126W 1011 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 MZM1YDR493W 372 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 IES5YER092W 378 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 RRF1YHR038W 693 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 BIG1YHR101C 1008 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SNC1YAL030W 354 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 SLM6YBR266C 453 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 RUD3YOR216C 1455 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 CDC53YDL132W 2448 nt2.18□□□□□ -2.06
HCS1P34243 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.17□□□□□ -2.06
HCS1P34243 TEN1YLR010C 483 nt2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.8 ms