Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms