Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CLIP1P30622 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms