Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCKSP29966 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms