Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP1P29466 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASP1P29466 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP1P29466 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP1P29466 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP1P29466 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms