Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 YKL111CYKL111C 336 nt2.74□□□□□ -1.97
PTP1P25044 ABF2YMR072W 552 nt2.74□□□□□ -1.97
PTP1P25044 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.74□□□□□ -1.97
PTP1P25044 RSM19YNR037C 276 nt2.74□□□□□ -1.97
PTP1P25044 NMA111YNL123W 2994 nt2.74□□□□□ -1.97
PTP1P25044 YSW1YBR148W 1830 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 ECM21YBL101C 3354 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 YGR151CYGR151C 336 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 YIL169CYIL169C 2988 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 SRL3YKR091W 741 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 TAR1YLR154W-C 375 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 RPL37AYLR185W 267 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 RPL20BYOR312C 519 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 ITC1YGL133W 3795 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 ARP7YPR034W 1434 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 SLN1YIL147C 3663 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 SAP1YER047C 2694 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 OSW7YFR039C 1533 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 UBP14YBR058C 2346 nt2.73□□□□□ -1.97
PTP1P25044 MSH4YFL003C 2637 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 AI2Q0055 2565 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 YDL062WYDL062W 426 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 RPL35AYDL191W 363 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 PCF11YDR228C 1881 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 ILS1YBL076C 3219 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 MMS1YPR164W 4224 nt2.72□□□□□ -1.97
PTP1P25044 FLO11YIR019C 4104 nt2.71□□□□□ -1.97
PTP1P25044 ALY1YKR021W 2748 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 BPT1YLL015W 4680 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PFF1YBR074W 2931 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 ERP6YGL002W 651 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 TIM8YJR135W-A 264 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 LCL1YPL056C 306 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PSK1YAL017W 4071 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 HBT1YDL223C 3141 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 VHR2YER064C 1518 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 VPS41YDR080W 2979 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 COX1Q0045 1605 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 NMD2YHR077C 3270 nt2.71□□□□□ -1.98
PTP1P25044 CSN9YDR179C 489 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YDR344CYDR344C 444 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 TIF35YDR429C 825 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 SDH2YLL041C 801 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 IES4YOR189W 351 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 MUS81YDR386W 1899 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 SKT5YBL061C 2091 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 VPS64YDR200C 1815 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PDS5YMR076C 3834 nt2.7□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YGL149WYGL149W 306 nt2.69□□□□□ -1.98
PTP1P25044 RPL14BYHL001W 417 nt2.69□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.69□□□□□ -1.98
PTP1P25044 snR49snR49 165 nt2.69□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PDC2YDR081C 2778 nt2.69□□□□□ -1.98
PTP1P25044 DIA2YOR080W 2199 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 TCB2YNL087W 3537 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PDR3YBL005W 2931 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 HTL1YCR020W-B 237 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YDL211CYDL211C 1119 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 DAD4YDR320C-A 219 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 TMA22YJR014W 597 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 RPL33AYPL143W 324 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 DAD3YBR233W-A 285 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 SLP1YOR154W 1764 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 ATP22YDR350C 2055 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YCL019WYCL019W 5313 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 ATG13YPR185W 2217 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 NPR2YEL062W 1848 nt2.68□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PMR1YGL167C 2853 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 HCS1YKL017C 2052 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 GUP1YGL084C 1683 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 TRZ1YKR079C 2517 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 RPA34YJL148W 702 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 ATP15YPL271W 189 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 SIR4YDR227W 4077 nt2.67□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YDL011CYDL011C 324 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YFH1YDL120W 525 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 NCE101YJL205C 162 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YNL338WYNL338W 159 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 YOR170WYOR170W 306 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 ISU1YPL135W 498 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 BNI4YNL233W 2679 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 ESL1YIL151C 3357 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 SGO1YOR073W 1773 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 KEL2YGR238C 2649 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 PRK1YIL095W 2433 nt2.66□□□□□ -1.98
PTP1P25044 TPS2YDR074W 2691 nt2.65□□□□□ -1.98
PTP1P25044 CWH41YGL027C 2502 nt2.65□□□□□ -1.99
PTP1P25044 JJJ2YJL162C 1752 nt2.65□□□□□ -1.99
PTP1P25044 TSA2YDR453C 591 nt2.65□□□□□ -1.99
PTP1P25044 YPR014CYPR014C 330 nt2.65□□□□□ -1.99
PTP1P25044 RAD61YDR014W 1944 nt2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.2 ms