Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNE1P24864 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms