Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GADD45AP24522 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GADD45AP24522 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms