Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B4P23634 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2B4P23634 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms