Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTF3P20783 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NTF3P20783 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NTF3P20783 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NTF3P20783 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms