Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARF4P18085 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARF4P18085 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARF4P18085 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARF4P18085 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARF4P18085 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms