Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DESP17661 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DESP17661 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DESP17661 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DESP17661 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DESP17661 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms