Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD1P17405 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms