Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSP16219 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACADSP16219 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACADSP16219 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACADSP16219 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACADSP16219 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACADSP16219 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACADSP16219 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSP16219 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSP16219 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms