Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB4P16144 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms