Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAV1P15498 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAV1P15498 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAV1P15498 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms