Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms