Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKBP12277 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKBP12277 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKBP12277 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKBP12277 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKBP12277 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKBP12277 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKBP12277 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKBP12277 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKBP12277 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKBP12277 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms