Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODC1P11926 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODC1P11926 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODC1P11926 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms