Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRFP10586 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms