Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms