Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBTFL1P0CB47 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBTFL1P0CB47 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBTFL1P0CB47 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms