Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXB7P09629 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB7P09629 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms