Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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