Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM2P07951 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM2P07951 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM2P07951 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPM2P07951 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPM2P07951 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms