Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHBP07195 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHBP07195 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms