Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3DP05423 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3DP05423 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms