Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGBP05060 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGBP05060 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGBP05060 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHGBP05060 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHGBP05060 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHGBP05060 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHGBP05060 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGBP05060 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGBP05060 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms