Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFPP02771 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFPP02771 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFPP02771 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFPP02771 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFPP02771 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms